José C. Faria

Formação

• 2008 - Pós-Doutorado (Estatística Computacional)
  Escola Superior de Agricultura Luiz de Queiroz, ESALQ, Brasil - Bolsista CNPq

• 2007 - Pós-Doutorado (Estatística Multivariada em Ambientes Computacionais de Código Aberto)
  Escola Superior de Agricultura Luiz de Queiroz , ESALQ, Brasil

• 2000 - Doutorado em Fitotecnia (Produção Vegetal)
  Universidade Federal de Viçosa, UFV, Brasil - Bolsista CNPq

• 1995 - Mestrado em Fitotecnia (Produção Vegetal)
  Universidade Federal de Viçosa, UFV, Brasil - Bolsista CAPES

• 1982 - Graduação em Engenharia Agronômica
  Universidade Federal de Viçosa, UFV, Brasil

Curriculo Lattes

José Cláudio Faria

Áreas de interesse

• Estatística computacional (ênfase em software de código aberto)
• Planejamento de experimentos e análise de dados
• Estatística multivariada
• Ensino de estatística

Projetos de pesquisa

1. Avaliação da sustentabilidade ambiental e socioeconômica de sistemas agroflorestais com cafeeiros no bioma Mata Atlântica. INCAPER - Instituto Capixaba de Pesquisa, Assistência Técnica e Extensão Rural. Coordenador: Eduardo Ferreira Sales. Financiado pela EMBRAPA-Café. Valor total do projeto: R$ 318.148,53. Valor da Ação: R$ 87.996,72. Duração: 01/2014 a 01/2018 (Em andamento).
2. Desenvolvimento de softwares no ambiente computacional R - PROPP: 00220.1300.1440 (Em andamento).
3. Desenvolvimento de software relacionados ao ambiente computacional R para uso em ensino, pesquisa e extensão - PROPP: 00220.1300.1063 (2011/2014).
4. Seleção de matrizes e propagação vegetativa da rambuteira (Nephelium Lappaceum) - PROPP: 00220.1000.783  (2009/2011).
5. Desenvolvimento e validação de uma escala de atitudes em relação à estatistica - PROPP: 00220.1300.761 (2009/2010).
6. Ambiente Virtual de Apoio ao Letramento Estatístico - AVALE - PROPP: 00220.1300.719 (2008/2010).
7. Suporte científico e tecnológico para avaliação e processamento de frutas tropicais visando ao fortalecimento da agricultura familiar na região sul da Bahia - PROPP: 00220.1000.778 (2008/2012).
8. Seleção e propagação vegetativa do Rambutanzeiro na região Sul da Bahia - PROPP: 00220.1000.412 (2004/2006).
9. Efeitos da deficiência de oxigênio (O2) no substrato sobre as gasosas foliares, a anatomia e o crescimento de mudas clonais de Theobroma cacao L. resistentes à vassoura-de-bruxa - PROPP: 00220.1100.388 (2004/2006).
10. Avaliação do uso de leguminosas como plantas de cobertura do solo em áreas clonais de cacaueiros tolerantes à vassoura-de-bruxa - PROPP: 00220.1000.352 (2003/2007).
11. Otimização nutricional das mudas na multiplicação massal e em escala industrial de material clonal de cacaueiros tolerantes à vassoura-de-bruxa (Crinipellis perniciosa (Stahel) Singer) - PROPP: 00220.1300.311 (2002/2006).
12. Propagação vegetativa da Pitangueira (Eugenia uniflora) pelo método de estaquia - PROPP: 00220.1000.308 (2002/2003).
13. A Modelagem hidrológica da bacia hidrográfica do Rio Cachoeira (BA) - PROPP: 00220.1000.195 (2000/2002).
14. Solos e ciclagem de nutrientes em ecossistemas de mangu no Sul da Bahia - PROPP:  00220.1000.210 (2000/2003).
15. Propagação vegetativa da Cajazeira (Spondias mombin L.) pelos métodos de estaquia e enxertia - PROPP: 00220.1000.213 (2000/2002).
16. Avaliação e seleção massal de genótipos de pitanga (Eugenia uniflora L.) na região Sul da Bahia - PROPP: 00220.1000.217 (2000/2002).
17. Bacia do Rio Cachoeira: Mapeamento dos solos quanto a propensão à densificação; Interpretação e mapeamento dos ambientes pelo sistema de avaliação da aptidão agrícola das terras - PROPP: 00220.1300.184 (2000/2003).

Projetos de extensão

1. Ferramentas estatísticas para análise de dados
2. Ferramentas computacionais para edição e processamento de texto

Publicações (últimos anos)

• <DOI> QUINTINO REIS de ARAUJO, GUILHERME AMORIM HOMEM de ABREU LOUREIRO, VIRUPAX CHANABASAPPA BALIGAR, DARIO ANHERT, JOSÉ CLAUDIO FARIA & RAUL RENÉ VALLE (2019) Cacao quality index for cacao agroecosystems in Bahia, Brazil, International Journal of Food Properties, 22:1, 1799-1814.

• <DOI> QUINTINO ARAUJO, DARIO AHNERT, GUILHERME LOUREIRO, JOSÉ FARIA, CINIRA FERNANDES & VIRUPAX BALIGAR (2018): Soil quality index for cacao cropping systems, Archives of Agronomy and Soil Science.

• <PAPER> ANTÔNIO W. O. ROCHA JUNIOR, GUILHERME A. H. A. LOUREIRO, QUINTINO R. ARAUJO, GEORGE A. SODRÉ, ARLICÉLIO Q. PAIVA, JOSÉ C. FARIA, ROSENILTON K. P. ARAÚJO. Evaluation of soil quality indicators by a participatory method in rural settlements in Southern Bahia, Brazil. Agrotrópica 27(3): 219 - 232. 2015.

• <PAPER> JELIHOVISCHI, E. G.; FARIA, J. C. & ALAMMAN, I. B. ScottKnott: A package for Performing the Scott-Knott Clustering Algorithm in R. Tendências em Matemática Aplicada e Computacioal - TEMA. 15(1):3-17. 2014.
• <EDITUS> FARIA, J. C.; GROSJEAN, P.; JELIHOVISCHI, E. G.; PIETROBON, R. Tinn-R Editor - GUI for R language and Environment. Editora Editus, Ilhéus, Bahia, Brasil. 2. ed. 267 p. PDF. eISBN: 978-85-7455-342-9. 2014.

• <PAPER> MELITO, M. O.; FARIA, J. C.; AMORIM, A. M. & CAZZETA, E. Demographic structure of a threatened palm (Euterpe edulis Mart.) in a fragmented Atlantic Forest landscape in northwestern Brazil. Acta Botanica Brasilica. 28(2):249-258. 2014.

• <DOI> SALES, E. F.; V. MÉNDEZ, V. M.; CAPORAL, F. R. & FARIA, J. C. Agroecological Transition of Conilon Coffee (Coffea canephora) Systems in the State of Espírito Santo, Brazil. Agroecology and Sustainable Food Systems, 37:4, 405-429. 2013.

• <DOI> LEITE, H. A. C.; SILVA, A. B.; GOMES, F. P.; GRAMACHO, K. P.; FARIA, J. C.; SOUZA, J. T. & LOGUERCIO, L. L. Bacillus subtilis and Enterobacter cloacae endophytes from healthy Theobroma cacao L. trees can systemically colonize seedlings and promote growth. Applied Microbiology and Biotechnology, v. (Epub, p. ahead of print), 2013.

• <RMETRICS> FARIA, J. C.; GROSJEAN, P.; JELIHOVISCHI, E. G.; PIETROBON, R. Tinn-R Editor. Rmetrics eBooks: Rmetrics Association & Finance Online Publishing, Zurich, 216p. 2010.

• <ISSN> COSTA, O. V.; CANTARUTTI, R. B.; FONTES, L. E. F.; COSTA, L. M.; NACIF, P. G. N.; FARIA, J. C. Estoque de carbono do solo sob pastagem em áreas de tabuleiro costeiro no sul da Bahia. Revista Brasileira de Ciência do Solo, v. 33, n. 5, p. 1137-1145. 2009.

Sofware

• Editores/GUIs/IDEs para o R (ordem cronológica)

  • Tinn-R Editor - GUI for R language and Environment (Windows)
  • NVim-R: Plugin para o Vim e NeoVim (Multi-Plataforma)

• Pacotes para o R (ordem cronológica)

  • bpca: Biplot de Dados Multivariados com Base na Análise de Componentes Principais (Biplot of Multivariate Data Based on Principal Component Analysis)
  • TinnR: Recursos do Tinn-R GUI/Editor para o ambiente R (Resources of Tinn-R GUI/Editor for R Environment)
  • ScottKnott: Algoritimo de Agrupamento de ScottKnott (The ScottKnott Clustering Algorithm)
  • fdth: Tabela de Distribuição de Frequências, Histogramas e Polígonos (Frequency Distribution Tables, Histograms and Poligons)
  • TukeyC: Teste de Tukey Convencional (Conventional Tukey Test)
  • TinnRcom: Recursos do Tinn-R Editor - GUI for R language and Environment:
    • O TinnRcom é um pacote para o R e não fica armazenado em repositórios, pois é distribuido (fonte e executável) juntamente com o editor Tinn-R na pasta package
    • Trata-se de uma reconstrução dos recursos necessário do editor Tinn-R baseada nas idéias dos pacotes: TinnR, NVim-R e svMisc
    • Embora com a mesma finalidade básica (prover da parte do R as informações necessárias ao editor Tinn-R) é completamente diferente do pacote TinnR além de possuir recursos adicionais
  • gexp: Generator of Experiments. O pacote gexp foi criado com o intuito de tornar possível  planejar, criar e modelar experimentos estruturados, isto é, sob um design experimental. 

Disciplinas que ministra regularmente na UESC

• CET076 - Metodologia e Estatística Experimental (Agronomia)
• CET083 - Probabilidade e Estatística (Ciência da Computação)