José C. Faria

Formation

• 2008 - Pós-Doutorate (Computational Statistical)
  Escola Superior de Agricultura Luiz de Queiroz, ESALQ, Brasil - CNPq

• 2007 - Pós-Doutorate (Multivariate Statistics in Open Source Computing Environments)
  Escola Superior de Agricultura Luiz de Queiroz , ESALQ, Brasil

• 2000 - Doctor in Crop Science (Plant Production)
  Universidade Federal de Viçosa, UFV, Brasil - CNPq

• 1995 - Master in Crop Science (Plant Production)
  Universidade Federal de Viçosa, UFV, Brasil - CAPES

• 1982 - Graduate in Agricultural Engineering
  Universidade Federal de Viçosa, UFV, Brasil

Lattes Curriculum

José Cláudio Faria

Áreas of interest

• Computational statistical (open source software emphasis)
• Experimental planning and data analysis
• Multivariate statistical
• Statistical teaching

Research projects

1. Avaliação da sustentabilidade ambiental e socioeconômica de sistemas agroflorestais com cafeeiros no bioma Mata Atlântica. INCAPER - Instituto Capixaba de Pesquisa, Assistência Técnica e Extensão Rural. Coordenador: Eduardo Ferreira Sales. Financiado pela EMBRAPA-Café. Valor total do projeto: R$ 318.148,53. Valor da Ação: R$ 87.996,72. Duração: 01/2014 a 01/2018 (Em adamento).
2. Desenvolvimento de softwares no ambiente computacional R - PROPP: 00220.1300.1440 (Em andamento).
3. Desenvolvimento de software relacionados ao ambiente computacional R para uso em ensino, pesquisa e extensão - PROPP: 00220.1300.1063 (2011-2014).
4. Seleção de matrizes e propagação vegetativa da rambuteira (Nephelium Lappaceum) - PROPP: 00220.1000.783  (2009/2011).
5. Desenvolvimento e validação de uma escala de atitudes em relação à estatistica - PROPP: 00220.1300.761 (2009/2010).
6. Ambiente Virtual de Apoio ao Letramento Estatístico - AVALE - PROPP: 00220.1300.719 (2008/2010).
7. Suporte científico e tecnológico para avaliação e processamento de frutas tropicais visando ao fortalecimento da agricultura familiar na região sul da Bahia - PROPP: 00220.1000.778 (2008/2012).
8. Seleção e propagação vegetativa do Rambutanzeiro na região Sul da Bahia - PROPP: 00220.1000.412 (2004/2006).
9. Efeitos da deficiência de oxigênio (O2) no substrato sobre as gasosas foliares, a anatomia e o crescimento de mudas clonais de Theobroma cacao L. resistentes à vassoura-de-bruxa - PROPP: 00220.1100.388 (2004/2006).
10. Avaliação do uso de leguminosas como plantas de cobertura do solo em áreas clonais de cacaueiros tolerantes à vassoura-de-bruxa - PROPP: 00220.1000.352 (2003/2007).
11. Otimização nutricional das mudas na multiplicação massal e em escala industrial de material clonal de cacaueiros tolerantes à vassoura-de-bruxa (Crinipellis perniciosa (Stahel) Singer) - PROPP: 00220.1300.311 (2002/2006).
12. Propagação vegetativa da Pitangueira (Eugenia uniflora) pelo método de estaquia - PROPP: 00220.1000.308 (2002/2003).
13. A Modelagem hidrológica da bacia hidrográfica do Rio Cachoeira (BA) - PROPP: 00220.1000.195 (2000/2002).
14. Solos e ciclagem de nutrientes em ecossistemas de mangu no Sul da Bahia - PROPP:  00220.1000.210 (2000/2003).
15. Propagação vegetativa da Cajazeira (Spondias mombin L.) pelos métodos de estaquia e enxertia - PROPP: 00220.1000.213 (2000/2002).
16. Avaliação e seleção massal de genótipos de pitanga (Eugenia uniflora L.) na região Sul da Bahia - PROPP: 00220.1000.217 (2000/2002).
17. Bacia do Rio Cachoeira: Mapeamento dos solos quanto a propensão à densificação; Interpretação e mapeamento dos ambientes pelo sistema de avaliação da aptidão agrícola das terras - PROPP: 00220.1300.184 (2000/2003).

Extension projects

1. Statistical tools for data analysis
2. Computer tools for text editing and processing

Publications (last years)

• <DOI> QUINTINO REIS de ARAUJO, GUILHERME AMORIM HOMEM de ABREU LOUREIRO, VIRUPAX CHANABASAPPA BALIGAR, DARIO ANHERT, JOSÉ CLAUDIO FARIA & RAUL RENÉ VALLE (2019) Cacao quality index for cacao agroecosystems in Bahia, Brazil, International Journal of Food Properties, 22:1, 1799-1814.

• <DOI> QUINTINO ARAUJO, DARIO AHNERT, GUILHERME LOUREIRO, JOSÉ FARIA, CINIRA FERNANDES & VIRUPAX BALIGAR (2018): Soil quality index for cacao cropping systems, Archives of Agronomy and Soil Science.

• <PAPER> ANTÔNIO W. O. ROCHA JUNIOR, GUILHERME A. H. A. LOUREIRO, QUINTINO R. ARAUJO, GEORGE A. SODRÉ, ARLICÉLIO Q. PAIVA, JOSÉ C. FARIA, ROSENILTON K. P. ARAÚJO. Evaluation of soil quality indicators by a participatory method in rural settlements in Southern Bahia, Brazil. Agrotrópica 27(3): 219 - 232. 2015.

• <PAPER> JELIHOVISCHI, E. G.; FARIA, J. C. & ALAMMAN, I. B. ScottKnott: A package for Performing the Scott-Knott Clustering Algorithm in R. Tendências em Matemática Aplicada e Computacioal - TEMA. 15(1):3-17. 2014.

• <EDITUS> FARIA, J. C.; GROSJEAN, P.; JELIHOVISCHI, E. G.; PIETROBON, R. Tinn-R Editor - GUI for R language and Environment. Editora Editus, Ilhéus, Bahia, Brasil. 2. ed. 267 p. PDF. eISBN: 978-85-7455-342-9. 2014.

• <PAPER> MELITO, M. O.; FARIA, J. C.; AMORIM, A. M. & CAZZETA, E. Demographic structure of a threatened palm (Euterpe edulis Mart.) in a fragmented Atlantic Forest landscape in northwestern Brazil. Acta Botanica Brasilica. 28(2):249-258. 2014.

• <DOI> SALES, E. F.; V. MÉNDEZ, V. M.; CAPORAL, F. R. & FARIA, J. C. Agroecological Transition of Conilon Coffee (Coffea canephora) Systems in the State of Espírito Santo, Brazil. Agroecology and Sustainable Food Systems, 37:4, 405-429. 2013.

• <DOI> LEITE, H. A. C.; SILVA, A. B.; GOMES, F. P.; GRAMACHO, K. P.; FARIA, J. C.; SOUZA, J. T. & LOGUERCIO, L. L. Bacillus subtilis and Enterobacter cloacae endophytes from healthy Theobroma cacao L. trees can systemically colonize seedlings and promote growth. Applied Microbiology and Biotechnology, v. (Epub, p. ahead of print), 2013.

• <RMETRICS> FARIA, J. C.; GROSJEAN, P.; JELIHOVISCHI, E. G.; PIETROBON, R. Tinn-R Editor. Rmetrics eBooks: Rmetrics Association & Finance Online Publishing, Zurich, 216p. 2010.

• <ISSN> COSTA, O. V.; CANTARUTTI, R. B.; FONTES, L. E. F.; COSTA, L. M.; NACIF, P. G. N.; FARIA, J. C. Estoque de carbono do solo sob pastagem em áreas de tabuleiro costeiro no sul da Bahia. Revista Brasileira de Ciência do Solo, v. 33, n. 5, p. 1137-1145. 2009.

Sofware

• Editors/GUIs/IDEs for R (cronological order)

  • Tinn-R Editor - GUI for R Language and Environment (Windows)
  • Nvim-R: Plugin for Vim and NeoVim (Multi-Plataform)

• Packages for R (cronological order)

  • bpca: Biplot of Multivariate Data Based on Principal Components Analysis
  • TinnR: Resources of Tinn-R GUI/Editor for R Environment
  • ScottKnott: The ScottKnott Clustering Algorithm
  • fdth: Frequency Distribution Tables, Histograms and Poligons
  • TukeyC: Conventional Tukey Test
  • TinnRcom: Tinn-R Editor reseources - GUI for R language and Environment:
    • The TinnRcom is a package for R and is not be stored in repositories, because it has distributed (source and executable) along with Tinn-R editor on the package folder
    • It is about a reconstruction of necessary resources of Tinn-R editor based on packages ideas: TinnR, Nvim-R and syMisc
    • Although with the same basic finality (provide by R’s part the necessary information for Tinn-R editor) is completely different of TinnR package also has additional resources

Disciplines who teaches regularly at UESC

• CET076 - Metodologia e Estatística Experimental (Agronomy)
• CET083 - Probabilidade e Estatística (Computer Science)